En 1995, l'État et les collectivités territoriales ont décidé de conjuguer leurs efforts pour mener le projet de rétablissement du caractère maritime du Mont-Saint-Michel, pour redonner au rocher sa part de marée et à l'édifice sa dimension de spiritualité.
L'État et le Syndicat Mixte ont engagé un programme exhaustif d'études, qui a permis de mettre au point le Programme Technique Détaillé en avril 1999.
En accompagnement des études, le Syndicat mixte a développé, pendant trois années, une concertation préalable avec les publics concernés. Le programme s'en est ainsi trouvé précisé et enrichi.
Sur ces bases, l'Instruction mixte lancée au sein des services de l'État a permis au Syndicat Mixte de mettre au point le programme en vue des enquêtes publiques.
Le budget de l'opération est chiffré à 164 millions d'euros, répartis entre les collectivités territoriales et l'État, avec les contributions de l'Union européenne et des agences de l'eau.
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